规章制度

上海科技大学生物电镜平台面向高水平、国际化的建设目标,立足于充分发挥平台高端电子显微镜的科研价值,有效支撑我校相关研究工作,特制定此高端电镜机时评审预约实施方案。


服务对象

上海科技大学生物电镜平台高端电子显微镜是重要的大型仪器设备和关键性研究资源,主要用以支持我校具有重大科学价值和应用意义的研究工作,面向上海科技大学所有在职员工和在读学生开放服务。平台以研究项目为单位进行机时需求的收集、评审和支持。

提出研究项目申请的申请人应为项目的实际主持者,须是受聘于上海科技大学的具有高级职称的研究人员,或者有两名同领域高级职称专家推荐的研究人员。


项目评审机制

为最大化资源利用效率,生物电镜平台致力于建设多种机制并存,相互促进、补充、平衡,整体上科学合理、灵活有效的系统化机时评审和分配解决方案。主要包括以下四种机制:

1) 专家委员会评审机制

此评审方案强调对研究项目科学意义和技术方案多角度、多维度的评估和探讨。每半年由用户委员会和部分邀请的外部机构同行组成的专家委员会匿名对项目的科学意义、可行性等多方面进行综合评价,提出建设性意见,并形成定量化的评分。项目执行周期(有效期)六个月。每个预约周期,根据各项目的申请,结合平台服务能力,按照项目评分由高到低依次满足机时需求。

2) 领导小组统筹机制

此评审方案强调对部分新开展的尚未及参加专家委员会评审项目的预先培育,对参加专家委员会评审后评分较低但经过调整项目基础有显著提高项目的途中扶持,以及大型项目和高竞争性项目的重点补充和优先支持,不设置集中的申请时间窗口,每个预约周期均可提出项目申请,项目持续有效,由平台领导小组根据申请课题的具体情况直接核准机时。必要时,领导小组可要求平台科学主任进行项目的技术可行性评估,或给出针对性的执行建议。为充分保障该类项目的实施和执行,平台投入不少于60%的服务能力予以保障,该比例将视平台具体运行情况由领导小组进行浮动调节。

3) 优秀项目奖励机制

利用生物电镜平台设施开展工作并在研究成果中予以书面致谢的项目,可在成果发表后的六个月内,申请获得奖励机时用以支持后续研究工作。申请奖励机时需要提交奖励机时申请书一份,学术海报一份(平台提供统一模板)以及发表学术论文的电子版。平台根据发表学术论文所在期刊当时影响因子作为主要的定量参考指标分配奖励机时(Cell/Nature/Science主刊文章,奖励4天机时;其他影响因子10分以上文章,奖励2天机时;影响因子10分以下文章,奖励1天机时),奖励机时的研究方案进入专家委员会评审,但天然获得最高评分。

4) 共建合作机制

为保持和增进与国内外各设施的技术交流,平台设置一部分机时与共建单位进行交流与共享。合作机时由领导小组审核设立,由合作方机构进行分配使用。目前立项开展合作共建的单位有:

合作单位

共享机时量

合作模式

有效期

中国科学院生物物理研究所

2.5/每仪器/

设施共建,机时分享

202003



项目的申请与有效期

所有项目申请的时间窗口均由生物电镜平台邮件进行告知。

项目申请人在提出使用申请时,需对拟开展研究工作的内容、方案、意义做较为明确的说明,必要时需要对研究所涉及样品的形式、性质、安全性等信息进行披露,具体请见《高端电镜项目申请书A类》和《高端电镜项目申请书B类》。

每个提出申请的项目会获得一个固定的项目编号,该项目编号跟随整个项目生命周期,是项目的唯一标识。

项目在超出有效期后可以进行延续申请(Renew), 具体请见《高端电镜项目A类续延申请书(Renew)》,延续申请的次数不做限制,但延续申请项目在评审和预约过程中会进行标注,同时在参加评审和预约过程中会强制附加其前序所有申请材料,以供评审专家或领导小组综合考量。


机时预约与使用

平台的机时以自然月为周期进行预约,预约时间窗口每月由生物电镜平台邮件进行告知。

参加专家委员会评审制的项目默认通过专家委员会评审制项目预约渠道预约机时,在特殊情况下(如总量不足、突发竞争、样品重大改良等)亦可申请通过领导小组统筹机时渠道预约机时。未经专家委员会匿名评审的项目,无法选择专家委员会评审制项目预约渠道预约机时。

专家委员会评审制项目不需要提供项目申请书,仅需提供项目编号和申请时长。领导小组统筹制项目需要提交完整项目申请书。所有项目的机时预约发送邮件至Bio-EM@shanghaitech.edu.cn (邮件模版详见附件一),该方式为唯一有效方式。

为了及时了解平台的设备运行状态和项目的技术需求,平台高端电镜采取使用后反馈制度。平台要求用户在每月向平台提交次月高端电镜的使用需求时,同时向平台反馈该项目上一次机时使用情况,并作为次月申请高端电镜机时的必要条件,即不鼓励项目在未处理完成前续收集过程中积累数据的情况下进行连续收集。具体请见附件《高端电镜使用情况反馈表》。

由于平台设备故障等计划外原因而产生的已分配机时无法执行的情况,机时不进行顺延调整,受影响项目的机时在次月机时中给予补偿。

因项目自身原因需要调换机时,需由项目负责人提前一个工作日通知平台管理员,征得管理员同意后,方可进行调换,未经预先告知核准的机时调换不受承认,机时将由平台进行回收。

对于200 kV Talos Arctica电镜机时,不再进行严格限制,已获得立项的项目负责人可根据需求,每周一在日历系统中自行预约不超过随后两个自然周的机时。在机时有冗余的情况下可开放未及立项的项目预约使用。


其他原则及说明

1) 有限管理原则

生物电镜平台服务主体为各研究项目,向平台领导小组负责,受用户委员会的监督,职责在于平台设施的运行维护,研究项目申请、立项、执行的组织协调,以及为相应研究工作的顺利开展提供技术保障。平台不谋求对课题组为主体的科学研究活动进行任何形式的管理或干涉,如不主动对课题组提交的项目数量进行限制,不开展以课题组为单位的任何层面的数据统计和披露。

2) 信任原则

平台信任用户提交的项目为其实际执行项目,不主动对项目的诚实执行进行监督。但平台保留对样品成分进行鉴定和识别的能力,如领导小组或项目负责人的主管单位提请检查,平台有如实调查和汇报的义务。

平台尊重研究项目的保密要求,各项目以编号形式出现在各类统计数据和排表中,进入申请流程的项目自然获得信息保护权利,平台确保不对任何评审或审核流程以外的主体透露项目信息,所有可能接触项目信息的平台工作人员以保密承诺书的形式进行保密宣誓。

3) 公平原则

平台承认项目之间在科学意义和技术挑战性上天然存在的差异,进而认可并尊重项目在所获支持资源的差异性。平台对不同项目的差异化支持,通过评审过程而自然实现。平台维护和保证各项目在申请和评审流程上的公平性。平台在服务能力允许范围内,不对项目机时进行额外的限制和非线性调控。

平台科学主任在应领导小组要求进行统筹机时项目技术可行性评估等工作过程中天然接触项目信息,如遭遇与自身研究工作竞争性项目,应主动向领导小组申明并回避。

1.      项目申请总分与机时计算方法:每份项目申请书的最终得分为所有评审专家给分的平均值,每台电镜的上限使用机时为所有评审专家推荐机时的平均值取整(采用四舍五入制),根据每半年电镜可提供的总机时进行相应比例的缩减或者增加。

2.     Application评分细则

2.1   评审内容:1Scientific importance,(2Technical innovation,(3Preliminary experiments sufficiency for high-end TEM times4Fruitful information for using high-end TEM

2.2   各项分数与总分:前四项内容每项得分为5档,最高分为5分,最低分为1分,每档相差1分。第四项最高分为1分,最低分为0.6分,每档相差为0.1分。申请书满分为10分。若评审专家未给出评分,则按最低分计分。

2.3   具体得分计算方法为:取前两项得分最高一项分数与第三项得分相加后乘以第四项,即为总分。具体计算公式为:

总分={MAX(第一项得分、第二项得分)+第三项得分第四项得分

例:

评审内容

得分

1.  Scientific importance

4

2.  Technical innovation

2

3.  Preliminary experiments sufficiency for high-end TEM times

5

4.  Fruitful information for using high-end TEM

0.8

总分

7.2

3.     Renew评分细则

3.1   评审内容:1Preliminary experiments sufficiency for high-end TEM times2Necessary for the further collection,(3Fruitful information for using high-end TEM,(4Microscope usage efficient of the last application

3.2   各项分数与总分:前两项内容得分分为5档,每项最高为5分,最低分为1分,每档分数相差1分。第三、四项得分也分为5档,每项最高分为0.50分,最低分为0.30分,每档相差0.05分。申请书满分为10分。

3.3   具体得分计算方法:

总分=(第一项得分+第二项得分×(第三项得分+项得分)

例:

评审内容

得分

1.  Preliminary experiments sufficiency for high-end TEM times

4

2.  Necessary for the further collection

4

3.  Fruitful information for using high-end TEM

0.45

4.  Microscope usage efficient of the last application

0.45

总分

7.2

 

 

200kV电镜机时:

对于200 kV Talos Arctica电镜机时,不再进行严格限制,已获得立项的项目负责人可根据需求,每周一在日历系统中自行预约不超过随后两个自然周的机时。在机时有冗余的情况下可开放未及立项的项目预约使用。


为了确保生物电镜平台科研辅助工作的顺利开展及实验室开放的安全,切实履行实验过程中安全防范工作,特制定本承诺书,本承诺书自签订之日起生效。

所有对生物电镜平台仪器设备有使用需求的用户均需签订此承诺书,承诺遵守以下所有规定:

一、生物电镜平台所属所有区域内均严禁吸烟,严禁一切明火,严禁用户在平台存放私人贵重物品、剧毒、易燃爆物品,不得带有传染性、有危险性的样品进入生物电镜平台,避免感染性、放射性、有机挥发、粉末状等及其他不适宜冷冻电镜的课题进入后续研究,用户在平台存放的所有物品安全自行负责

二、生物电镜平台所有实验区域内(包括各电镜房、玻璃房、制样间)严禁饮食,用户产生的垃圾自行带走,用户进入生物电镜平台前,必须穿上鞋套。

三、严禁用户在平台所有区域内私接电线、随意搭接电源,注意防水、防盗、防火等,发现问题应及时联系电镜平台工作人员,并通知校园服务中心,联系电话:20685112,保证实验室的仪器设备正常使用。

四、用户在生物电镜平台进行实验期间,如仪器使用遗忘或使用仪器出现问题,在平台工作人员工作时间内有权寻求平台工作人员的现场协助。

五、用户在生物电镜平台进行实验期间,遵守本平台制定的仪器培训、考核、预约和使用管理办法,遵守用户守则,用户必须考核通过及获得平台工作人员授权后,严格按操作规程使用电镜平台所有仪器设备,不得违规使用,不得私自进行上样,不得私自调换机时,不得未经预约私自使用电镜,如果课题紧急需取得该台仪器的管理员授权。严禁进行超过仪器使用条件的测试。

六、用户在进入平台进行实验前,必须掌握各类安全自救常识。

七、用户离开实验室时,必须进行安全检查,门、窗、电是否关闭或切断,并做好仪器使用和耗材使用登记工作,确认无误才能离开。

八、用户保证在使用平台设施和仪器设备时不带其他无关人员进入平台实验室,不将平台仪器设备交由未经平台授权的人员使用。

九、用户在开始实验前应仔细检查仪器设备是否运行正常,确定仪器设备运行正常后方可进行实验;如发现仪器设备运行有故障,必须立即停止仪器使用,不得盲目行事,应立即报告电镜平台工作人员,并在《仪器使用记录本》上注明故障现象,隐瞒不报者将被追究责任

十、除授权使用的仪器设备及配套设施外,用户不得随意动用实验室内的其他设备和设施,未经授权不得带走实验室包括试剂、耗材等的任何物品。

十一、严禁用户查看、更改、拷贝、散发其他用户资料。用户实验完成后,应立即导出数据,如因不及时导出数据而造成的数据丢失,由该用户自行负责。

十二、仪器设备需要定期的维护,一般不会影响对外开放的时间。如遇特殊情况需要紧急停止实验(如:电镜故障、换液氮罐、气路电路维护、系统维护或管理员培训等),管理员将提前通知实验人,并且有权及时停止实验。

十三、用户在平台工作人员非工作时间内使用本平台所有仪器设备,必须保证使用期间所使用的设备仪器安全、使用区域的安全和自身的安全,用户及其课题组在平台非工作时间内(非工作时间包括工作日的下班时间、双休日、国家法定节假日和学校规定的寒暑假)进行实验负有全部安全责任,用户可避免在非工作时间内使用本平台的仪器设备。

十四、由于下列原因造成仪器设备和高值耗材损坏或丢失的,认定为责任事故,应予全额赔偿:

1)尚未掌握操作规程或未了解性能及使用方法,不听从管理员指导告知、不遵守操作规程,违反基本安全常识,擅自使用、移动、拆卸造成仪器设备损坏的;

2)未履行必要的登记手续,擅自将工作场所仪器及工具携带出工作场所或携至校外造成损坏或丢失的;

3)在实验过程中,由于自身的操作失误造成的仪器设备及高值耗材损坏损毁的;

4)在实验过程中,指导他人进行实验操作,操作人使用不当引起的设备损坏,由操作人承担赔偿责任;

5)未经准入考核,擅自让校外人员进入实验室造成的仪器设备损坏或丢失的;

十五、由下列原因造成仪器设备损坏或丢失的,经调查平台及上级单位鉴定为确实难以避免的,可酌情减免赔偿:

1)因实验操作本身的特殊性(如检修、试运行等)确实难以避免,而引起损失的;

2)因仪器设备本身的缺陷或因长期高频次使用至接近报废程度,在正常使用时发生合理自然损耗的;

3)经过批准,试用非常见设备或试行新的实验操作方法,虽然采取预防措施,仍未能避免损坏的;

4)因供使用时被盗抢,且有公安部门或学校保卫处出具报案记录或证明的;

5)由其他客观原因(发生无法预见的情况如未提前通知的停电、停水等)或不可抗力造成意外损坏的,且由相关部门证明及单位情况说明的。

十六、所有对生物电镜平台仪器设备有使用需求的用户均需签订此承诺书,如因违反本承诺书所造成的一切损失均由各课题组自负责任。

十六、用户在进行实验期间本着自愿遵守生物电镜平台安全承诺书的原则,履行相关职责并注意自身安全,若违规操作发生人身意外伤害,均与本平台无关。

十七、本办法最终解释权归上海科技大学生物电镜平台,所有实验人员需仔细阅读本规定并签署承诺书。未签订此承诺书的用户不得使用本平台所有仪器设备,如有违反,造成的一切后果均由该用户承担,并取消其电镜平台所有设备仪器的使用权限。

 

承诺人:                                    课题组负责人:

                                      日    

冻电镜高性能计算平台包括预处理集群与图信中心集群。预处理集群进行电镜数据的预处理操作,图信中心集群进行高性能电镜数据处理。图信集群共有80CPU计算节点,每个节点配备两个Intel Xeon E5-2690 V4处理器,共计2240个处理器核;22GPU节点,分别配备了四卡P100和四卡P40;此外还配备了一个2TB的大内存胖节点。图信集群的CPU理论单精度浮点峰值计算性能达到120.4TFlopsGPU的理论单精度浮点计算峰值达966.4TFlops;存储可用总容量达3.5PB

1.  图信中心集群计算资源的队列设置

1.1目前针对电镜数据设置的缺省队列如下:



队列名 含节点数 节点关键参数
CPU1 10 核数14*2/节点
CPU8 10 核数14*2/节点
GPU_A 8 4*P100/节点
GPU_B 6 4*P40/节点
cryosparc1 1 4*P100/节点
cryosparc2 1 4*P100/节点
FAT 1 64个核/2TB内存


高性能计算集群中电镜数据计算资源目前只提供给使用高端电镜收数据的课题组使用。

1.2 针对计算生物方向的数据处理有八个GPU节点,目前挂靠在平台与电镜集群统一管理,但所有权归计算生物课题组,分为一个单独队列:

队列名

含节点数

节点关键参数

GPU_2

8

4*P100/节点


1.3 2020810日召开电镜管理委员会会议,通过了集群资源的收费政策,自202111日开始执行。计算资源部分的收费标准如下:

节点类型

CPU

GPU_A

GPU_B

FAT

收费标准

0.04/核时

7.5/节点时

5/节点时

2.5/节点时

2. 关于集群账号的规定


2.1 集群账号

2.1.1集群账号命名规则:

集群中账号以用户的校园网邮箱名字命名,如用户的校园网邮箱为xyz@shanghaitech.edu.cn,则申请集群账号为xyz,如此可以保证账号的唯一性。

2.1.2集群账号的申请方式:

有使用集群需求的用户使用校内邮箱发送申请邮件到平台公共邮箱Bio-EM@shanghaitech.edu.cn,邮件主题标明“申请集群账号”,并在邮件中注明学院/所、课题组以及计算需求。如课题组内学生替PI申请,需同时抄送PI,集群管理员收到PI回复同意的邮件后建立账号并发送账号信息到与账号同名的校内邮箱。

2.2 cryoSPARC节点账号

2.2.1 cryoSPARC节点账号命名规则:

账号以用户的校园网邮箱命名,如用户的校园网邮箱为xyz@shanghaitech.edu.cn,则申请cryoSPARC节点账号为xyz@shanghaitech.edu.cn,如此可以保证账号的唯一性。

2.2.2 cryoSPARC节点账号的申请方式:

有使用cryoSPARC节点需求的用户使用校内邮箱发送申请邮件到平台公共邮箱Bio-EM@shanghaitech.edu.cn,并同时抄送所在课题组PI,邮件主题标明“申请cryoSPARC节点账号”,并在邮件中注明学院/所、课题组,集群管理员在收到PI回复同意的邮件后建立账号并发送账号信息到与账号同名的校内邮箱并抄送PI

2.3集群账号的使用:

2.3.1  2019716日电镜平台管理委员会会议决定每个课题组共用PI账号,自此,电镜处理集群账号使用规则是同一课题组成员统一使用所在课题组PI的账号。

2.3.2 用户在预处理集群与图信集群上有相同名称的集群账号,在预处理集群上账号仅用来运行预处理程序;在图信集群上,用户账号用来做数据处理以及提交作业。

2.3.3 用户要及时更改集群账号的初始密码,并妥善保管账号密码,如因密码泄露导致的数据丢失或损坏由用户自行承担。

2.3.4 用户需要遵守集群使用的规范,不得在管理节点上运行作业程序,否则管理员有权提出警告,如用户连续三次违反规定将剥夺提交作业权限。

3.  关于集群中数据存储的管理规定:

目前预处理存储提供可用容量为600TB的空间,图信中心主集群存储(后文称为主存储)提供可用容量为3.5PB的空间。预处理存储用来临时存放收集的原始电镜数据及做数据预处理,原始数据被实时同步到图信中心的主存储。主存储是所有集群用户的公有资源,不仅存储原始数据,还用来做数据处理以及存储处理的结果数据。由于容量有限,需要各用户珍惜使用。

3.1 集群存储中的数据存放路径为:/home/用户名/EM_data/日期+名字标识的文件夹,其中“用户名”指用户账号,如/home/xyz/EM_data/20200525_abc文件夹存储了用户账户xyx2020525日收集的电镜数据,收集人abc。用户收集数据时按照上述规则命名存储文件夹。

3.2 数据存储的管理:

3.2.1 预处理存储的空间作为数据的中转空间,需要管理员经常清理,一般会保留近三个月的数据。

3.2.2 为了避免存储空间的无效占用,用户需及时清理主存储中由于计算产生的Trash数据及重复数据。

3.2.3 用户课题在文章发表之后需要将除原始数据之外的数据从主存储中清除。

3.2.4 用户需要自觉地及时地备份主存储中的原始数据,用户通过文件传输服务器将数据拷贝到移动硬盘设备中。如果用户没有及时备份的情况下,由于集群存储出现硬件故障导致数据丢失或损坏,则用户自己承担数据损失的责任。

3.2.5 由于使用电镜的课题组众多,存储空间将会日益紧张,为了保证电镜数据收集及同步能正常进行,主存储的数据益控制在85%以下,数据达到该比例,管理员将会做清理工作,按照时间顺序从最早的数据开始清理,清理之前会与用户确认是否用户已备份。

3.2.6 使用client账户的外部用户的数据,自收数据日起,在预处理存储和图信存储中分别保留三个月及二个月时间,电镜管理员在外部用户收数据时需告知该期限。

3.2.7 2020810日召开电镜管理委员会会议,通过了集群资源的收费政策,自202111日开始执行。存储部分的收费标准如下:

校内用户每个账号50TB及以下免费,最高配额不得超过200TB。采取分级计费方式,具体价格见下表:

存储用量

价格

50TB

0

50TB-100TB

100// TB

100TB-150TB

200// TB

150TB-200TB

400//TB

>200TB

800//TB

4. 计算资源限制以及优先级的设置与管理:

4.1 计算资源限制规则:

由于GPU节点计算资源有限,为了保证用户公平的使用资源,目前集群对一些队列设置了一定的资源限制规则:GPU_A队列每个用户账号最多同时使用8张卡,每个队列最多提交两个作业。

管理员可以根据资源的使用频率,微调资源限制规则,如假期期间,如果使用的课题组较少,可以适当放宽限制,以免产生虽有空余资源但计算任务重的课题组无法使用的情况。

4.2 计算资源优先占用的设置规则:

如课题组从事的课题研究具有非常重要的意义,并有很强的时效性,可以向电镜管理领导小组申请部分计算资源优先占用或独享占用,经领导小组批准后,由管理员做相应设置,并通过平台公共邮箱发邮件通知所有用户资源变动情况。

一般优先或独享占用的时间不能超过一个月,如果一个月时间计算任务不能完成,申请课题组需在一个月时间结束前提前向领导小组重新提交申请,重新获得批准后方可继续延长使用特权。

总则 

1.    海科技大学生命科学电镜平台是上海科技大学的校级平台,服务于上海科技大学的科学研究工作。

2.    为科学研究提供有力支撑是平台所有工作的核心及根本出发点,也是政策制定,设备购置和日常管理的落脚点;

3.    台运维团队保障冷冻电镜的正常运转及合理使用,在日常运行管理上具有独立性及权威性;

4.    公平和高效是平台运行的两块基石;

5.    用户分级管理制度。

 

 


 

 

 


 

TOC \o 1-3 \h \z \u 一、平台工作人员守则... PAGEREF _Toc41989717 \h 3

二、平台仪器使用规章制度及违规惩罚措施... PAGEREF _Toc41989718 \h 4

三、Talos L120C射电镜预约使用规定... PAGEREF _Toc41989719 \h 6

四、Talos L120C透射电镜冷冻杆的使用注意事项... PAGEREF _Toc41989720 \h 7

五、制样间Vitrobot及Vitrobot公用镊子使用说明... PAGEREF _Toc41989721 \h 8


一、平台工作人员守则

1.   权责明确,分工协作,在自己负责范围内要尽职尽责、积极主动完成工作。

2.   早晚例行检查实验室设备仪器参数、水电安全。保持实验室常用耗材充足,物品摆放整洁有序。

3.   做好用户的技术培训、考核工作,有序合理地安排实验,协助用户进行实验,耐心解答用户问题,及时纠正用户不规范实验操作,随时发现和改进工作中的不足,确保工作质量和效率。

4.   仪器设备如有故障、更新、升级(硬件变动、软件升级、增加新的附件或功能)、培训等情况,应及时通知用户。

5.   实验结束后,协助用户拷贝数据并提醒用户登记。

6.   及时清理和规范公共数据存储空间,确保公共软件可正常使用。

7.   检查当天晚上(或非工作时间)是否有人实验,实验人是否符合非工作时间实验规定,实验用品等是否齐备,并做好交代。

8.   平台工作人员应严格遵照平台规定,不对用户做超出规定之外的承诺。如有用户提出超出本规定范围的要求或违反本规定的情况,需立即请示上级领导。

9.   对违反平台规定、工作拖沓、推诿搪塞用户、态度不好等影响正常运转工作秩序、损害平台形象和名誉的行为,施以约谈、批评教育、警告、再培训等处理措施。

 

二、平台仪器使用规章制度及违规惩罚措施

1.   新用户须接受培训考核且考核通过后方可独立使用仪器,对于没有独立使用资格的用户平台可进行协助观察样品,需要提前说明。没有独立使用资格的用户如果需要预约非工作时间需要已通过考核用户全程陪同,且独立使用资格的用户不得私自进行独立实验操作。使用仪器过程中出现问题由实验人和陪同人员共同负责。

2.   具有独立使用仪器资格的用户必须严格遵守管理规定,在已授权限内使用仪器。

3.   上机使用前请用户对仪器及需要使用到的高值耗材进行状态检查,如有故障请立即向管理员汇报并在设备登记本上做好记录。仪器使用后必需登记并对仪器及高值耗材状态做出简要评估并签字。

4.   使用仪器期间出现的异常情况(如仪器或高值耗材故障等情况)请立即向管理员汇报并做好详细登记说明工作,严禁在仪器负责人不知情的情况下随意处理,以免损坏仪器,影响使用。

5.   用户必须保持电镜室的卫生清洁,实验完毕后请将所有工具及附件放回原处便于后续用户使用,并请及时清理实验区域。

6.   在电镜平台公共区域内暂时放置的个人物品必须注明姓名、联系方式和研究组以及单位,未经允许的私人物品不允许放在平台公用区域。管理员将对未标明归属的私人物品进行定期清理。

7.   实验数据应放在指定的存储空间内,请及时拷贝备份数据。本地存储数据的硬盘每月清理一次,经提醒后仍没有做数据拷贝的数据丢失责任由用户自负。

8.   电镜仪器、制样仪器及辅助设备内置参数未经管理员同意不允许随意更改。

9.   请按照所需机时预约使用,严禁浪费。

10.  未经允许用户不得私自带领校外人员来电镜平台做实验或参观,如有需要请提前联系平台管理人员,征得同意后方可进行。

11.  不准携带食物、饮料等进入仪器设备室,在休息区域进食饮水后必须及时清洁,以保证实验区域的安全和清洁。

12.  仪器设备需要定期的维护,一般不会影响对外开放的时间。如遇特殊情况需要紧急停止实验(如:电镜及附属设备故障、换液氮罐、气路电路维护、系统维护或管理员培训等),管理员将提前通知用户,并且有权择期停止实验。

13.  对违反上述规定的用户,将给予相应处罚,处罚措施如下

1)   使用电镜时违反以下任意一项操作规范的行为第一次会向用户发出警告,连续两次则暂停违规者使用资格半个月,若造成损失或产生相关维修费用由违规者实验室全权承担。

Ø  不允许在电镜室进食,不允许将易洒液体饮料等放到电镜室桌面上,实验结束后将实验用具及时归为,清理实验台保持桌面整洁等;

Ø  注意实验室环境安全,杜绝安全隐患:使用台灯后需关闭,使用吹风机后电源插头需拔下,拖线板不能直接放在地上等;

Ø  不允许私自更改电镜室配套设施的参数设置(如空调温度,消磁设备设置等);

Ø  操作电镜时需遵照基本电镜操作规范:下样前将倍数降至LM倍数范围,放下荧光屏,退出物镜光阑;非最后一位用户需将液氮杯内加满液氮,晚上最后一位用户结束实验后做cryocycle等;

2)   使用电镜时违反以下任意一项操作规范的行为暂停违规者使用资格一个月若造成损失或产生相关维修费用由违规者实验室全权承担。

Ø  累计两次预约后不来做实验且不通知管理员,同时造成次日实验设备故障。

Ø  预约机时不允许私自转移给其他用户,非工作时间仅限有独立操作资格的人预约使用。一经发现暂停预约者和实际使用者双方使用资格一个月。

Ø  未通过考核用户预约非工作时间后,已通过考核的用户必须全程陪同,未通过考核用户不得私自上下样。一经发现暂停预约人和陪同人使用资格一个月。

Ø  使用过程中遇到异常情况不汇报、不登记,造成仪器无法正常使用。

3)   没有预约,而且未经管理员同意私自使用相关仪器者,发现后直接暂停违规者使用资格三个月,若在此期间造成损失或者产生相关维修费用由违规者实验室全权承担。

4)   发现仪器异常且不汇报强行继续使用者,违规操作造成重大事故,造成的损失及相关维修费用由违规者实验室全权承担,暂停违规者及其所在实验室所有其他用户使用资格三个月

 

所有的违反规定的行为,不论是否会影响电镜正常运转均会将情况通报违规者所在实验室PI


三、Talos L120C透射电镜预约使用规定 

1.   120kV电镜用户必须通过平台的培训和考核,方能进行的仪器自主预约使用。考核通过后,校内egate注册用户可以进入上海科技大学egate-仪器共享平台,在相应的仪器页面内点击“参加培训”进行使用权限的申请,管理员审核通过后会对申请用户进行授权。授权过的用户即可在此系统内对相应仪器进行预约使用。

2.   预约的机时仅供预约人使用,不允许私自转移他人使用,按预约账户和系统记录的已使用机时作为后续的收费依据,预约人为其预约使用时间段内的第一负责人。

3.   预约人如需取消机时,预约时间段的12个小时前在系统上自行取消,距离预约开始时间已不满12小时的,需向管理员进行告知申请。

4.   如有特殊要求或者加急测试,请提前与相关仪器负责人沟通。

5.   当一台120kV电镜发生故障时,将不允许用户在运行正常的120kV电镜上进行操作练习,直至故障电镜恢复正常运行,以最大限度保障120kV电镜的正常运行。

6.   如果您的项目进展到一定阶段,切实有冷冻实验需求要在120kV电镜上开展但未获得独立实验使用资格,可以向管理员或者已经通过平台常温或冷冻样品杆考核的高级用户寻求帮助,严格遵守平台的陪同制度,签订安全责任书之前严禁独立使用。

7.   如有其他问题,如有任何意见、建议,以及其他特殊情况,可以邮件形式发送至平台邮箱进行反馈。欢迎咨询电镜平台相关工作人员。

四、Talos L120C透射电镜冷冻杆的使用注意事项 

1.   使用前后找管理员当面确认低温样品杆的状态;若在非工作时间,以实时图片来确认;

2.   使用冷冻样品杆及pump station要单独严格登记;

3.   每周由管理员统一做bake out,用户正常用完只需做warm up即可。

4.   用户可以自行购买冷冻杆使用,不受平台冷杆使用规则限制。

五、制样间VitrobotVitrobot公用镊子使用说明 

1.   Vitrobot使用要先经过培训,培训通过后即获得独立使用权限。

2.   由于Vitrobot镊子使用时需要非常小心,因此鼓励各课题组自行购置Vitrobot镊子。

3.   Vitrobot镊子由管理员统一管理,需要使用可在工作时间向管理员提出需求并进行登记,如果在非工作时间使用请提前提出需求。

4.   在领用与归还镊子时向管理员或者上一个用户当面检查镊子状态。如归还时发现镊子有损坏,本次用户需要承担全部责任,即购买一把新的镊子归还平台。

5.   使用Vitrobot的用户有责任维持制样间的清洁及安全,违规者第一次会进行提醒,第二次则禁用本仪器一个月。

6.   Vitrobot及配件的使用要严格登记,使用后不登记一经发现立即禁止使用制样设备一个月。

7.   使用后要及时关闭乙烷总阀,乙烷为易燃易爆危险气体,发现违规者即刻取消使用制样设备资格三个月。

8.   制样间严禁明火,一经发现取消使用制样设备资格三个月。

冷冻/超薄切片机的使用预约必须通过平台的培训和考核,获取独立操作权限后,方能进行的仪器自主预约使用。考核通过后,校内egate注册用户可以进入上海科技大学egate-仪器共享平台,在相应的仪器页面内点击“参加培训”进行使用权限的申请,管理员审核通过后会对申请用户进行授权。授权过的用户即可在此系统内对相应仪器进行预约使用。

备注:平台可提供超薄切片所用玻璃刀,若需要钻石刀请各课题组自行购买,或委托平台管理员协助切片。


高压冷冻仪的使用预约必须通过平台的培训和考核,获取独立操作权限后,方能进行的仪器自主预约使用。考核通过后,校内egate注册用户可以进入上海科技大学egate-仪器共享平台,在相应的仪器页面内点击“参加培训”进行使用权限的申请,管理员审核通过后会对申请用户进行授权。授权过的用户即可在此系统内对相应仪器进行预约使用。


冷冻替代仪的使用预约必须通过平台的培训和考核,获取独立操作权限后,方能进行的仪器自主预约使用。考核通过后,校内egate注册用户可以进入上海科技大学egate-仪器共享平台,在相应的仪器页面内点击“参加培训”进行使用权限的申请,管理员审核通过后会对申请用户进行授权。授权过的用户即可在此系统内对相应仪器进行预约使用。


其他制样类仪器的使用请联系管理员详询具体预约使用事宜(支撑团队链接)。

首次来本平台进行实验的用户需主动联系平台工作人员,并接受实验室管理规定、实验操作、仪器使用、实验安全等的培训。具体培训流程详述如下:

每月进行一次冷冻制样(包括VitrobotEMGP2)和负染色制样的培训,每次培训时长约2小时,培训时间、地点会至少提前一周通知用户,方便用户进行报名。为保证培训质量,尽量让每个用户在培训期间都能亲自练习,每次培训限报人数上限为4人,每个课题组限报人数上限为2人。

每月根据实际申请情况安排一次集中冷冻制样(包括VitrobotEMGP2)的考核时间,每次考核限4人,考核时间、地点会提前一周通知用户。用户可在已通过考核用户陪同下积累使用经验,时间累积标准根据自身掌握情况进行决定,熟练掌握后即可向管理员申请考核。


Vitrobot预约使用流程:

1. 使用前提

用户必须通过平台的 Vitrobot 培训及考核

所有用户必须签署上海科技大学生物电镜平台实验室安全承诺书(含仪器设备及高值耗材赔偿条款).docx

2. 授权预约权限

校内用户通过自己的上科大邮箱发送申请邮件至平台邮箱 Bio-EM@shanghaitech.edu.cn,由平台管理员将申请人邮件加入仪器预约的共享日历系统。

3. 机时预约

用户可登陆上科大邮箱,在日历目录下选择并打开所选用仪器的共享日历,预约不超过两个自然周的机时,然后在预约时间段使用仪器。

4. 使用注意事项

仪器使用完成后必须做好实验收尾工作,如果接用了平台的镊子,需在归还时交由管理员对镊子的完好度进行检查。

乙烷气瓶使用完毕后需关闭并拧紧主阀

相关文档资料下载:

制样技术培训-201909版.docx

Aquilos电镜的使用申请采取项目评审方式进行,包括以下四种机制:1,专家委员会评审机制(A类申请)。每半年由用户委员会和部分邀请的外部机构同行组成的专家委员会匿名对项目进行评审,通过审批的项目执行周期(有效期)为六个月。2,领导小组统筹机制(B类申请)。每个月末均可提交项目申请书,由平台领导小组根据申请课题的具体情况核准机时,通过审批的项目执行周期为1个月。3,优秀项目奖励机制。利用生物电镜平台设施开展工作并在研究成果中予以书面致谢的项目,可在成果发表后的六个月内,申请获得奖励机时用以支持后续研究工作。平台根据发表学术论文所在期刊当时影响因子作为主要的定量参考指标分配奖励机时(Cell/Nature/Science主刊文章,奖励4天机时;其他影响因子10分以上文章,奖励2天机时;影响因子10分以下文章,奖励1天机时),奖励机时的研究方案进入专家委员会评审,但天然获得最高评分。

用户可填写Aquilos样品测试申请书,发送至平台邮箱(Bio-EM@shanghaitech.edu.cn)进行机时申请。申请书审核通过后,可根据所分配的机时联系管理员进行预约。


共享系统预约使用流程

  

申请项目在审批通过并且分配机时后,可通过登陆上科大大型仪器预约共享系统,进入相应的仪器设备目录,进行实验预约及签到、签退流程。

1使用前提

Aquilos电镜预约使用必须有申请项目

所有用户必须签署上海科技大学生物电镜平台实验室安全承诺书(含仪器设备及高值耗材赔偿条款).docx

2进入网址

用户通过自己的egate账号密码登录以下网址:http://eshare.shanghaitech.edu.cn/,统一身份认证登录,进入系统。

3找到仪器

进入系统后,用户在左侧仪器管理条目中,点击进入仪器目录,点击搜索,选择组织机构:上海科技大学 — iHuman研究所 — 公共科研平台 — 生物电镜平台,点击查询,将出现生物电镜平台所有大型仪器共享设备。

4共享系统授权

用户可将有使用需求的平台仪器设备加入关注,以便下次快速进入。

点击进入有使用需求的电镜,请仔细阅读该仪器公告,仪器名称旁有申请参加培训提示,用户点击“参加培训”,管理员会给符合预约条件的用户授权共享系统的预约权限。

5仪器预约

用户通过共享系统申请后,需提前在共享系统上预约该仪器,预约如下:点击进入该仪器,点击使用预约:

Aquilos电镜用户添加使用预约界面。填写课题组及关联项目,备注上填写项目号,预约规则为当日9点到之后N天的9点(八点五十几分至九点零几分区间内浮动),可在添加使用预约界面更改起始时间和结束时间。如果同一人预约多天,则可以在同一备注上将所需项目号依次写上。

6仪器登录使用

Aquilos电镜用户预约成功后需在使用当日在相应设备的打卡机上用校园卡进行签到,并于实验结束当天上午九点左右在共享系统上进行签退。

7使用注意事项

Aquilos电镜使用完成后记得及时签退,以防系统多计费,造成课题组的经费损失。


上海科技大学生物电镜平台实验室安全承诺书(含仪器设备及高值耗材赔偿条款).docx

Aquilos 样品测试申请书 new.docx

首次来本平台进行实验的用户需主动联系平台工作人员,并接受实验室管理规定、实验操作、仪器使用、实验安全等的培训。用户级别(对应的操作权限)及培训考核流程详述如下:

用户级别:

初级用户:完全没用任何使用经验的电镜用户,管理员可以进行培训并协助检测样品,需提前预约机时并预约管理员时间,不允许未通过考核人员独立使用电镜。初级用户的培训也可以由各课题组已通过考核的人员帮助培训。

中级用户:能够独立开展常温样品杆上下样、升降电流高压、常规电镜调机等操作,能够熟练掌握以上操作的人员可提前预约机时并预约管理员进行一级考核。

高级用户:能够独立开展常温及低温样品杆的上下样,低剂量成像技术等操作,能够熟练掌握以上操作的人员可提前预约机时并预约管理员进行二级考核。


培训制度:

原则上每月进行两次次集中培训,每次培训总时长约7小时,培训时间、地点、类型会至少提前一周通知用户,培训报名方式为微信报名小程序,培训通知将会通过网站通知、微信群和邮件进行通知。为保证培训质量,尽量让每个用户在培训期间都能亲自实践,每次培训限报人数上限为4人,每个课题组限报人数上限为2人。培训日期管理员会进行提前通知。 平台设置的常温及冷杆操作培训可反复多次报名,期间产生的机时费用由参加培训的用户们共同承担。申请参加冷冻样品杆培训的用户必须先通过常温杆操作培训。且在冷冻样品杆培训过程中,不设置用户直接上手实践的过程。申请练习冷冻杆的用户必须要进行多次、长时间的观摩学习,具有20小时以上的常温杆使用经验,且签订高值耗材使用安全责任书,方可申请练习使用冷杆。120kV电镜的培训安排会尽量在不影响用户的正常使用的情况下开展。当一台120kV电镜发生故障时,原定培训时间和次数将酌情更改,以最大限度保障另一台120kV电镜的正常运行。

考核制度:

1、接受完培训的用户在管理员或者已通过考核用户陪同下积累使用经验,时间累积标准请参照平台的规则:常温杆在考核前需要累积40小时的练习时间、冷冻杆的考核需要在常温杆累积时间的基础上增加20小时。熟练掌握后可向管理员申请考核,考核每月设置一次,时间、地点会提前一周通知用户,考核不通过者需要再累加20小时的练习时间方可参与下一次考核。注:每次练习时间的累积需要找管理员签字确认。

2、考核标准:实际上机操作加口试问答。

3、考核通过后签订安全责任书,会授予用户相应级别的独立使用仪器资格。

4、已通过考核的用户如果长期没有使用电镜,以及出现多次掉真空情况,需要管理员对实际情况进行评估,如有必要,用户需重新积累20小时,再进行考核。

5、声明:电镜平台透射电镜用户培训考核只针对上海科技大学校内用户开放。


预约使用规定:

1、120kV电镜用户必须通过平台的培训和考核,方能进行的仪器自主预约使用。考核通过后,校内egate注册用户可以进入上海科技大学egate-仪器共享平台,在相应的仪器页面内点击“参加培训”进行使用权限的申请,管理员审核通过后会对申请用户进行授权。授权过的用户即可在此系统内对相应仪器进行预约使用。

2、预约的机时仅供预约人使用,不允许私自转移他人使用,按预约账户和系统记录的已使用机时作为后续的收费依据,预约人为其预约使用时间段内的第一负责人。

3、预约人如需取消机时,预约时间段的12个小时前在系统上自行取消,距离预约开始时间已不满12小时的,需向管理员进行告知申请。

4、如有特殊要求或者加急测试,请提前与相关仪器负责人沟通。

5、当一台120kV电镜发生故障时,将不允许用户在运行正常的120kV电镜上进行操作练习,直至故障电镜恢复正常运行,以最大限度保障120kV电镜的正常运行。

6、如果您的项目进展到一定阶段,切实有冷冻实验需求要在120kV电镜上开展但未获得独立实验使用资格,可以向管理员或者已经通过平台常温或冷冻样品杆考核的高级用户寻求帮助,严格遵守平台的陪同制度,签订安全责任书之前严禁独立使用。

7、如有其他问题,如有任何意见、建议,以及其他特殊情况,可以邮件形式发送至平台邮箱进行反馈。欢迎咨询电镜平台相关工作人员。

8、请在预约备注上写明“使用者姓名 - PI - 常温/冷冻”。累积两次不备注预约将被视为无效,三次及以上将被取消使用资格,再次使用需重新进行独立操作考核。


共享系统预约使用流程

1. 使用前提

120kV电镜用户必须通过平台的培训及考核

所有用户必须签署上海科技大学生物电镜平台实验室安全承诺书(含仪器设备及高值耗材赔偿条款).docx

2. 进入网址

用户通过自己的egate账号密码登录以下网址:http://eshare.shanghaitech.edu.cn/,统一身份认证登录,进入系统。

3. 找到仪器

进入系统后,用户在左侧仪器管理条目中,点击进入仪器目录,点击搜索,选择组织机构:上海科技大学 — iHuman研究所 — 公共科研平台 — 生物电镜平台,点击查询,将出现生物电镜平台所有大型仪器共享设备。

4. 共享系统授权

用户可将其有使用需求的本平台仪器设备加入关注,以便下次快速进入。

点击进入有使用需求的电镜,请仔细阅读该仪器公告,仪器名称旁有申请参加培训提示,用户点击参加培训,管理员会给考核通过的用户通过共享系统申请。

5. 仪器预约

用户通过共享系统申请后,需提前在共享系统上预约该仪器,预约如下:点击进入该仪器,点击使用预约:

120kV电镜用户双击界面,在添加使用预约对话框内编辑预约信息,依次填写课题组、起始时间、结束时间、关联项目等信息,请在预约备注上写上使用者姓名-PI-常温/冷冻,确认后即为预约成功。

6. 仪器登录使用

120kV电镜用户预约成功后,在预约时间段内到达平台使用120kV电镜,用户需要使用 egate 账号登录 120kV 电镜,如下:Account egate 账号,选择 UIAPassword egate 密码。Submit 即可,不需要填写 IC Card NO

7. 使用注意事项

120kV电镜使用完成后必须退出自己的账号,否则会持续收费,并在弹出的窗口上填写样品数、自己所属课题组经费、电镜使用反馈!每天最后一个用户使用完电镜后,请关闭灯丝与高压,做上 cryocycle后退出账户,非最后一个用户使用结束后将冷阱加满液氮,关闭灯丝,保留电压开启状态。因各种原因临时取消机时预约请务必告诉管理员。

共享软件只是控制显示屏,不需要账号在登陆状态下做cryocycle

已获得300kV电镜立项的项目负责人可根据需求,进行200 kV Talos Arctica电镜机时的预约,每周一在仪器共享系统中自行预约不超过随后两个自然周的机时。在机时有冗余的情况下可开放未及立项的项目预约使用。

共享系统预约使用流程

申请项目在审批通过并且分配机时后,可通过登陆上科大大型仪器预约共享系统,进入相应的仪器设备目录,进行实验预约及签到、签退流程。

1使用前提

用户必须签署上海科技大学生物电镜平台实验室安全承诺书(含仪器设备及高值耗材赔偿条款).docx

2进入网址

用户通过自己的egate账号密码登录以下网址:http://eshare.shanghaitech.edu.cn/,统一身份认证登录,进入系统。

3找到仪器

进入系统后,用户在左侧仪器管理条目中,点击进入仪器目录,点击搜索,选择组织机构:上海科技大学 — iHuman研究所 — 公共科研平台 — 生物电镜平台,点击查询,将出现生物电镜平台所有大型仪器共享设备。

4共享系统授权

用户可将有使用需求的平台仪器设备加入关注,以便下次快速进入。

点击进入有使用需求的电镜,请仔细阅读该仪器公告,仪器名称旁有申请参加培训提示,用户点击“参加培训”,管理员会给考核通过的用户通过共享系统申请。

5仪器预约

用户通过共享系统申请后,需提前在共享系统上预约该仪器,预约如下:点击进入该仪器,点击使用预约:

用户添加使用预约界面。预约规则为当日9点到之后N天的9点(八点五十几分至九点零几分区间内浮动),可在添加使用预约界面更改起始时间和结束时间。如果同一人预约多天,则可以在同一备注上将所需项目号依次写上。

6仪器登录使用

用户预约成功后需在使用当日在共享系统上进行签到,在第二天九点左右在共享系统上进行签退,签到在egate系统上进入仪器共享平台,找到当时预约的机器,点击签到,打开仪器后,因系统反应延迟,界面还是显示签到,只需要刷新一下网页,无需点击第二次签到。

7使用注意事项

200kV电镜使用完成后记得及时签退,以防系统多计费,造成课题组的经费损失。

评审规则

Titan系列电镜的使用申请采取项目评审方式进行,包括以下四种机制:

1专家委员会评审机制(A类申请)。每半年由用户委员会和部分邀请的外部机构同行组成的专家委员会匿名对项目进行评审,通过审批的项目执行周期(有效期)为六个月。

2领导小组统筹机制(B类申请)。每个月末均可提交项目申请书,由平台领导小组根据申请课题的具体情况核准机时,通过审批的项目执行周期为1个月。

3优秀项目奖励机制。利用生物电镜平台设施开展工作并在研究成果中予以书面致谢的项目,可在成果发表后的六个月内,申请获得奖励机时用以支持后续研究工作。平台根据发表学术论文所在期刊当时影响因子作为主要的定量参考指标分配奖励机时(Cell/Nature/Science主刊文章,奖励4天机时;其他影响因子10分以上文章,奖励2天机时;影响因子10分以下文章,奖励1天机时),奖励机时的研究方案进入专家委员会评审,但天然获得最高评分。

4共建合作机制。为保持和增进与国内外各设施的技术交流,平台设置一部分机时与共建单位进行交流与共享。合作机时由领导小组审核设立,由合作方机构进行分配使用。


项目的申请与有效期

所有项目申请的时间窗口均由生物电镜平台邮件进行告知。

项目申请人在提出使用申请时,需对拟开展研究工作的内容、方案、意义做较为明确的说明,必要时需要对研究所涉及样品的形式、性质、安全性等信息进行披露,具体请见内容下方附件《高端电镜项目申请书A类》和《高端电镜项目申请书B类》。

每个提出申请的项目会获得一个固定的项目编号,该项目编号跟随整个项目生命周期,是项目的唯一标识。

项目在超出有效期后可以进行延续申请(Renew), 具体请见内容下方附件《高端电镜项目A类续延申请书(Renew)》,延续申请的次数不做限制,但延续申请项目在评审和预约过程中会进行标注,同时在参加评审和预约过程中会强制附加其前序所有申请材料,以供评审专家或领导小组综合考量。


机时预约与使用

平台的机时以自然月为周期进行预约,预约时间窗口每月由生物电镜平台邮件进行告知。

参加专家委员会评审制的项目默认通过专家委员会评审制项目预约渠道预约机时,在特殊情况下(如总量不足、突发竞争、样品重大改良等)亦可申请通过领导小组统筹机时渠道预约机时。未经专家委员会匿名评审的项目,无法选择专家委员会评审制项目预约渠道预约机时。

专家委员会评审制项目不需要提供项目申请书,仅需提供项目编号和申请时长。领导小组统筹制项目需要提交完整项目申请书。所有项目的机时预约发送邮件至Bio-EM@shanghaitech.edu.cn (邮件模版详见附件一),该方式为唯一有效方式。

为了及时了解平台的设备运行状态和项目的技术需求,平台高端电镜采取使用后反馈制度。平台要求用户在每月向平台提交次月高端电镜的使用需求时,同时向平台反馈该项目上一次机时使用情况,并作为次月申请高端电镜机时的必要条件,即不鼓励项目在未处理完成前续收集过程中积累数据的情况下进行连续收集。具体请见附件《高端电镜使用情况反馈表》。

由于平台设备故障等计划外原因而产生的已分配机时无法执行的情况,机时不进行顺延调整,受影响项目的机时在次月机时中给予补偿。

因项目自身原因需要调换机时,需由项目负责人提前一个工作日通知平台管理员,征得管理员同意后,方可进行调换,未经预先告知核准的机时调换不受承认,机时将由平台进行回收。

对于200 kV Talos Arctica电镜机时,不再进行严格限制,已获得立项的项目负责人可根据需求,每周一在日历系统中自行预约不超过随后两个自然周的机时。在机时有冗余的情况下可开放未及立项的项目预约使用。


共享系统预约使用流程

申请项目在审批通过并且分配机时后,可通过登陆上科大大型仪器预约共享系统,进入相应的仪器设备目录,进行实验预约及签到、签退流程。

1使用前提

高端电镜(200kV300kV)必须有申请项目

所有用户必须签署上海科技大学生物电镜平台实验室安全承诺书(含仪器设备及高值耗材赔偿条款).docx

2进入网址

用户通过自己的egate账号密码登录以下网址:http://eshare.shanghaitech.edu.cn/,统一身份认证登录,进入系统。

3找到仪器

进入系统后,用户在左侧仪器管理条目中,点击进入仪器目录,点击搜索,选择组织机构:上海科技大学 — iHuman研究所 — 公共科研平台 — 生物电镜平台,点击查询,将出现生物电镜平台所有大型仪器共享设备。

4共享系统授权

用户可将有使用需求的平台仪器设备加入关注,以便下次快速进入。

点击进入有使用需求的电镜,请仔细阅读该仪器公告,仪器名称旁有申请参加培训提示,用户点击“参加培训”,管理员会给符合预约条件的用户授权共享系统的预约权限。

5仪器预约

用户通过共享系统申请后,需提前在共享系统上预约该仪器,预约如下:点击进入该仪器,点击使用预约:

高端电镜用户添加使用预约界面。填写课题组及关联项目,备注上填写项目号,预约规则为当日9点到之后N天的9点(八点五十几分至九点零几分区间内浮动),可在添加使用预约界面更改起始时间和结束时间。如果同一人预约多天,则可以在同一备注上将所需项目号依次写上。

6仪器登录使用

高端电镜用户预约成功后需在使用当日在共享系统上进行签到,并于实验结束当天上午九点左右在共享系统上进行签退。签到方式为:在egate系统上进入仪器共享平台,找到当时预约的机器,点击签到。注意!由于因系统反应所造成的延迟,界面可能会显示待签到状态,此时只需要刷新一下网页即可,无需进行再次签到。

7使用注意事项

高端电镜使用完成后记得及时签退,以防系统多计费,造成课题组的经费损失。


相关链接及文档下载:

上海科技大学生物电镜平台高端机时评审预约实施方案

上海科技大学生物电镜平台高端电镜项目专家委员会评审细则

上海科技大学生物电镜平台高端电镜项目申请书A类.docx

高端电镜项目申请书A类续延申请书(Renew).docx

高端电镜项目申请书B类.docx

上海科技大学生物电镜平台高端电镜使用情况反馈表 (2020).docx

机时预约邮件格式模板(300kV).docx

Talos C-Twin透射电镜预约规定:

1. 上海科技大学egate网上预约可预约工作时间(9:00-13:00, 13:00-17:00)、非工作时间(1700-230023:00-次日3:00

2. 每周一开始预约不超过两个自然周的机时;

3. 预约的机时仅供自己使用,不允许转给他人使用,按预约账户和预约机时收费。非工作时间仅限有独立操作资格的人预约使用,若发现未获得使得资格的人使用,取消预约者和实际使用者二人的预约资格一个月

4. 已预约机时取消至少提前一天用户直接电话联系管理员021-20684412取消预约。如在预约时间开始后提出取消,属于浪费机时,按照正常时长收费,每个季度连续三次以上将取消预约其预约资格一个月。

5. 实验提前结束后需通知管理员,以方便其他用户预约使用,提高仪器使用效率。建议用户按需要预约使用,浪费情况严重的预约者取消预约资格一个月

6. 如有其他问题,欢迎咨询电镜平台相关工作人员。

规章制度

1. 新用户须接受培训考核且考核通过后方可独立使用仪器,对于没有独立使用资格的用户平台可进行协助观察样品,需要提前预约。

2. 具有独立使用仪器资格的用户方可在非工作时间使用相应仪器,请提前领取钥匙并保管好,等工作日归还工作人员。

3. 实验结束将实验用具及时归位,清理实验台并做好各项实验记录,异常情况必须及时通报管理员并做好详细登记说明工作,切勿擅自处理

4. 电镜平台公共区域仪器内放置个人物品必须注明姓名、联系方式和研究组以及单位,以便在发生故障等紧急情况时通知本人,未经允许的物品不允许随便放在平台公用区域

5. 实验数据应放在指定的存储空间内,请做好及时拷贝工作,存储数据用硬盘每月清理一次,经提醒后仍没有做数据拷贝的数据丢失责任由用户自负。

6. 请按照所需机时预约,严禁浪费。

7. 未经允许用户不得随意带领人员来电镜平台做实验或参观,如有需要请提前联系告知平台管理人员,征得同意后方可进行,并对其所带领人员在平台的行为负责。

8. 对违反平台规定的用户,将给予相应处罚。