Q EXACTIVE HF质谱主要应用于蛋白质组研究中的高分辨、高精度鉴定和定量研究，适于对复杂蛋白质及肽段混合物进行高效分离并进行高灵敏度、高准确性和高通量的分析。扫描速度达18 Hz；分辨率可达240,000FWHM。

用于蛋白质组学研究，支持多种定量方法，包括平行反应监测（PRM）和数据独立性采集（DIA）等。